Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC7A4O43246 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms