Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHOX2AO14813 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms