Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EIF3FO00303 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms