Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms