Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPA3F8WFD2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms