Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms