Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms