Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT02

TRAV9-2, T-cell receptor alpha variable 9-2 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV9-2A0A087WT02 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV9-2A0A087WT02 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV9-2A0A087WT02 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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