Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD54BQ9Y620 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms