Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MED16Q9Y2X0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms