Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SBNO2Q9Y2G9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms