Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCQ9Y266 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms