Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRQQ9UMZ3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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