Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms