Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MKLN1Q9UL63 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms