Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms