Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGA2Q9UJY4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGA2Q9UJY4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms