Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLIP2Q9UDT6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLIP2Q9UDT6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms