Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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