Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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