Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-18Q9QC07 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms