Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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