Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms