Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALKBH4Q9NXW9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms