Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms