Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms