Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms