Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms