Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXO8Q9NRD0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO8Q9NRD0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms