Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms