Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms