Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms