Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC6A16Q9GZN6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A16Q9GZN6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms