Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP1-5Q9BYS1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms