Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms