Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4AQ9BY43 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms