Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms