Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2orf88Q9BSF0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms