Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms