Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms