Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NAP1L3Q99457 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms