Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms