Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms