Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms