Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC7Q96M83 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms