Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf48Q96LS8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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