Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EP400Q96L91 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms