Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms