Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms