Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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